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德诺沃抗体测序服务

创意生物实验室很高兴展示一系列独特的德诺沃抗体测序研究服务,诊断的,以及治疗行业。为了克服目前传统排序方法的缺点,创新生物实验室开发了数据库辅助散弹枪排序(DASS)技术,基于我们的下一代抗体测序平台。我们的服务包括可变区域,可变+先导区域,以及所有物种的全长重链和轻链抗体测序,同种型,同种异型。纯化的多价单克隆抗体可以100%覆盖所需区域,并且具有良好的准确性。许多来自创新生物实验室的成功案例证实了我们的资格,能够提供10vwin0%准确度和满意度的抗体测序,以满足客户的需求。

我们的世界领先达斯系统为

新抗体测序服务图一德诺沃抗体测序工作流程。

仪器仪表

我们可以使用高场轨道飞行器精英混合MS(Thermo Scientific),分辨率为240.000,质量精度小于1 ppm,来执行我们的服务。可用的碎片技术将包括CID,HCD和ETD。这些技术的结合使用可以确保最大的覆盖范围,为我们的客户产生高质量的结果。

序列验证保证

正如我们所知,您的项目时间紧迫,我们验证序列,以确保您的抗体将在第一次尝试时发挥作用。

(1)将确定还原轻链和重链的质量,以验证确定的序列。轻链序列必须在+/-1.2 da范围内匹配。对于重链,+允许1.8 da。如果确定的序列与蛋白质质量不匹配,你不会被起诉。(请注意,这个偏差小于两个质子的重量。)

(2)抗体中的每一个突变将通过至少两个有意义的光谱进行验证。这样可以确保序列不包含等压交换。不要单独依赖肽图。[等压交换是相同质量的交换,如gg=n,YM=FM(Ox)。一些竞争对手使用的肽图通常对这种错误不敏感。]

保险范围保证

如果整个V(D)J区的覆盖率不超过5倍,你不会被起诉。您也可以预订我们的10倍服务。我们不会停止序列,除非我们有10倍的V(D)J覆盖。

用DASS对V、J和C段进行测序

抗体的v、j和c基因片段可在公共数据库中获得。然而,在抗体成熟的过程中,B细胞将过度突变引入序列以优化亲和力。我们的映射算法是容错的,可以将“突变”的肽与相应的种系匹配。可靠地。

由于大量的肽,我们得到抗体中每个肽键的序列信息。通常情况下,20-70不同ms/ms每个氨基酸(AA)位置都会产生光谱。因此,即使是最困难的脯氨酸和富含精氨酸的肽序列也能被分解。由于所有氨基酸的顺序都很清楚,不需要像埃德曼测序这样耗时的技术。

德诺沃cdr3区域的测序

虽然轻链的cdr3主要由种系序列编码,重链的cdr3通常在数据库中不可用。它由所谓的D段编码,但这些被核酸酶和末端转移酶修饰。通常情况下,成熟抗体中只剩下1-4个氨基酸的D段。D段的其余部分是“人工的”,必须进行排序。德诺沃.

我们的方法在破碎过程中产生许多重叠的肽,使我们能够对未知的氨基酸进行很长的序列分析。高质量的MS/MS光谱与智能数据挖掘相结合,允许我们像看书一样阅读cdr3。这项技术非常强大,我们能够测序出一个20kDa的蛋白质,在数据库中没有同源。

等压氨基酸

与其他基于MS的方法相比,我们可以区分大多数等压氨基酸组合。例如。:


荧光色素单克隆抗体的测序,IgMs以及其他非标准抗体

新抗体测序服务图2样本测序结果。

其他特征

如果您对我们的DASS技术感兴趣,请随意调查我们了解更多细节。




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