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德诺沃抗体测序服务

创意生物实验室is glad to show a series of unique德诺沃抗体测序services for research,诊断的,以及治疗行业。To overcome the current drawbacks of sequencing based on traditional methods,创新生物实验室开发了数据库辅助散弹枪排序(DASS)技术,基于我们的下一代抗体测序平台。我们的服务包括可变区域,可变+先导区域,以及所有物种的全长重链和轻链抗体测序,同种型,同种异型。Purified monoclonal antibodies in multivalent forms can be sequenced with 100% coverage of the desired regions as well as excellent accuracy.许多来自创新生物实验室的成功案例证实了我们的资格,能够提供10vwin0%准确度和满意度的抗体测序,以满足客户的需求。

Our world-leading达斯system provides reliable supporting proof for

De Novo Antibody Sequencing Services图一德诺沃抗体测序工作流程。

仪器仪表

我们可以使用高场轨道飞行器精英混合MS(Thermo Scientific),分辨率为240.000,质量精度小于1 ppm,来执行我们的服务。可用的碎片技术将包括CID,HCD和ETD。The combined usage of these technologies could ensure the maximum coverage to generate high-quality results for our clients.

序列验证保证

As we are aware that your projects have tight timelines we validate the sequences to ensure that your antibody will be functional with the first attempt.

(1)将确定还原轻链和重链的质量,以验证确定的序列。轻链序列必须在+/-1.2 da范围内匹配。对于重链,+允许1.8 da。如果确定的序列与蛋白质质量不匹配,你不会被起诉。(请注意,这个偏差小于两个质子的重量。)

(2)抗体中的每一个突变将通过至少两个有意义的光谱进行验证。这样可以确保序列不包含等压交换。不要单独依赖肽图。[等压交换是相同质量的交换,如gg=n,YM=FM(Ox)。一些竞争对手使用的肽图通常对这种错误不敏感。]

保险范围保证

如果整个V(D)J区的覆盖率不超过5倍,你不会被起诉。您也可以预订我们的10倍服务。我们不会停止序列,除非我们有10倍的V(D)J覆盖。

用DASS对V、J和C段进行测序

抗体的v、j和c基因片段可在公共数据库中获得。然而,在抗体成熟的过程中,B细胞将过度突变引入序列以优化亲和力。我们的映射算法是容错的,可以将“突变”的肽与相应的种系匹配。可靠地。

由于大量的肽,我们得到抗体中每个肽键的序列信息。通常情况下,20-70不同ms/ms每个氨基酸(AA)位置都会产生光谱。因此,即使是最困难的脯氨酸和富含精氨酸的肽序列也能被分解。由于所有氨基酸的顺序都很清楚,不需要像埃德曼测序这样耗时的技术。

德诺沃cdr3区域的测序

虽然轻链的cdr3主要由种系序列编码,重链的cdr3通常在数据库中不可用。它由所谓的D段编码,但这些被核酸酶和末端转移酶修饰。通常情况下,成熟抗体中只剩下1-4个氨基酸的D段。D段的其余部分是“人工的”,必须进行排序。德诺沃.

我们的方法在破碎过程中产生许多重叠的肽,使我们能够对未知的氨基酸进行很长的序列分析。高质量的MS/MS光谱与智能数据挖掘相结合,允许我们像看书一样阅读cdr3。这项技术非常强大,我们能够测序出一个20kDa的蛋白质,在数据库中没有同源。

等压氨基酸

与其他基于MS的方法相比,we can discriminate most isobaric amino acid combinations.例如。:


Sequencing of Fluorochrome mAbs,IgMs以及其他非标准抗体

De Novo Antibody Sequencing Services图2样本测序结果。

其他特征

如果您对我们的DASS技术感兴趣,请随意inquiry我们了解更多细节。




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